Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms