Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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CUL4AQ13619 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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CUL4AQ13619 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
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CUL4AQ13619 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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CUL4AQ13619 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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