Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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MTMR3Q13615 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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