Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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PEX6Q13608 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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PEX6Q13608 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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PEX6Q13608 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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PEX6Q13608 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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PEX6Q13608 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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PEX6Q13608 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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PEX6Q13608 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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PEX6Q13608 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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PEX6Q13608 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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PEX6Q13608 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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