Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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