Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR5A1Q13285 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms