Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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STRN3Q13033 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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STRN3Q13033 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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STRN3Q13033 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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STRN3Q13033 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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STRN3Q13033 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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STRN3Q13033 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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STRN3Q13033 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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