Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FOXI1Q12951 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms