Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms