Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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