Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms