Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.2 ms