Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms