Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms