Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms