Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms