Protein–RNA interactions for Protein: Q01167

FOXK2, Forkhead box protein K2, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXK2Q01167 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXK2Q01167 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms