Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN7AQ01118 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN7AQ01118 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN7AQ01118 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN7AQ01118 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN7AQ01118 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN7AQ01118 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN7AQ01118 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN7AQ01118 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN7AQ01118 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN7AQ01118 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN7AQ01118 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN7AQ01118 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN7AQ01118 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms