Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms