Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME5P56597 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NME5P56597 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NME5P56597 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NME5P56597 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NME5P56597 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NME5P56597 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NME5P56597 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NME5P56597 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NME5P56597 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NME5P56597 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NME5P56597 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NME5P56597 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NME5P56597 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NME5P56597 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NME5P56597 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NME5P56597 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NME5P56597 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NME5P56597 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NME5P56597 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NME5P56597 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NME5P56597 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NME5P56597 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NME5P56597 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NME5P56597 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms