Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms