Protein–RNA interactions for Protein: P52306

RAP1GDS1, Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GDS1P52306 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1GDS1P52306 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms