Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms