Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms