Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms