Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms