Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms