Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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