Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCL3L1P16619 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms