Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms