Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF888P0CJ79 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF888P0CJ79 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF888P0CJ79 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF888P0CJ79 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF888P0CJ79 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF888P0CJ79 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF888P0CJ79 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF888P0CJ79 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF888P0CJ79 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF888P0CJ79 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF888P0CJ79 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF888P0CJ79 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF888P0CJ79 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF888P0CJ79 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF888P0CJ79 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF888P0CJ79 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF888P0CJ79 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF888P0CJ79 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF888P0CJ79 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF888P0CJ79 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF888P0CJ79 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF888P0CJ79 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF888P0CJ79 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF888P0CJ79 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF888P0CJ79 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF888P0CJ79 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF888P0CJ79 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF888P0CJ79 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF888P0CJ79 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF888P0CJ79 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF888P0CJ79 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF888P0CJ79 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF888P0CJ79 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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