Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms