Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LTAP01374 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LTAP01374 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LTAP01374 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LTAP01374 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LTAP01374 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LTAP01374 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms