Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F9P00740 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F9P00740 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F9P00740 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
F9P00740 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
F9P00740 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F9P00740 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F9P00740 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F9P00740 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F9P00740 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms