Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms