Protein–RNA interactions for Protein: O60235

TMPRSS11D, Transmembrane protease serine 11D, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11DO60235 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.2 ms