Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP290O15078 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP290O15078 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP290O15078 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP290O15078 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP290O15078 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP290O15078 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP290O15078 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP290O15078 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP290O15078 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP290O15078 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP290O15078 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP290O15078 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP290O15078 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP290O15078 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP290O15078 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP290O15078 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP290O15078 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP290O15078 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP290O15078 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP290O15078 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP290O15078 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP290O15078 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP290O15078 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP290O15078 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP290O15078 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP290O15078 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP290O15078 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP290O15078 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP290O15078 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP290O15078 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP290O15078 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP290O15078 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP290O15078 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP290O15078 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP290O15078 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP290O15078 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP290O15078 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP290O15078 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP290O15078 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP290O15078 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP290O15078 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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CEP290O15078 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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CEP290O15078 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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CEP290O15078 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP290O15078 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP290O15078 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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CEP290O15078 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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CEP290O15078 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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CEP290O15078 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP290O15078 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP290O15078 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP290O15078 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP290O15078 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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CEP290O15078 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP290O15078 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP290O15078 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP290O15078 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP290O15078 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP290O15078 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP290O15078 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP290O15078 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP290O15078 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP290O15078 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP290O15078 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP290O15078 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP290O15078 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP290O15078 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP290O15078 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP290O15078 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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