Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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BCKDKO14874 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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BCKDKO14874 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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BCKDKO14874 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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BCKDKO14874 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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BCKDKO14874 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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BCKDKO14874 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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BCKDKO14874 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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BCKDKO14874 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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BCKDKO14874 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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BCKDKO14874 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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