Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

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Length 899 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT4C9JH25 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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