Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 FUT8-204ENST00000394586 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 PRPF40B-202ENST00000380281 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 COL8A1-202ENST00000273342 3029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 PAX8-205ENST00000429538 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 OSBP2-208ENST00000437268 3580 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 RASAL1-201ENST00000261729 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 AC126564.1-201ENST00000623628 2013 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 FAM198B-207ENST00000592057 3425 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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