Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms