Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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ARL2-SNX15V9GYD0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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ARL2-SNX15V9GYD0 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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