Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms