Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CPNE7Q9UBL6 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms