Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms