Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms