Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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VAPAQ9P0L0 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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VAPAQ9P0L0 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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VAPAQ9P0L0 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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VAPAQ9P0L0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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