Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
KRT84Q9NSB2 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms