Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 242 ms