Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4GALTQ9NPC4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms